Este proyecto plantea un estudio multidisciplinar para descubrir biomoléculas que sirvan para vigilar la salud del hígado, detectar las alteraciones que anuncien el inicio de la enfermedad y definir dianas novedosas contra las que dirigir nuevos fármacos.
TomoXliver2 - CM
Abordaje multiómico y estructural al estudio de los mecanismos de respuesta del hepatocito al daño inflamatorio.
Referencia: S2022/BMD-7232
Objetivos
El hígado es un órgano especializado que desempeña un papel crucial en la regulación del metabolismo, la nutrición y la respuesta inmunitaria. Las enfermedades hepáticas crónicas, como la cirrosis y el cáncer, son responsables de más de 2 millones de muertes cada año.
En este proyecto, nos enfocamos en la colestasis, una enfermedad que interrumpe el transporte adecuado de ácidos biliares desde los hepatocitos hasta el intestino. La colestasis puede ser causada por obstrucciones o mutaciones genéticas que alteran la estructura y función de los hepatocitos. También puede ser provocada por inflamación hepática debido a una respuesta inflamatoria sistémica, como la septicemia.
Aprovechando los avances en interactómica, proteómica, fosfoproteómica y procesamiento de imágenes obtenidos durante el proyecto TomoXliver, llevaremos a cabo un estudio multidisciplinario sobre el efecto de la colestasis intrahepática familiar progresiva (PFIC) y la colestasis inducida por respuesta inflamatoria sistémica en los hepatocitos.
Nuestros objetivos son la identificación de proteínas, microproteínas y metabolitos relacionados con la progresión de enfermedades hepáticas. Además, nos enfocamos en la dinámica de las interacciones proteína-proteína y la caracterización estructural de proteínas relevantes en la colestasis, como ABCB4 y NHERF1, y sus cambios conformacionales durante la colestasis de origen genético PFIC3.
Our Vision
The liver is a specialized organ that plays a crucial role in regulating metabolism, nutrition and immune response. Chronic liver diseases, such as cirrhosis and cancer, are responsible for more than 2 million deaths each year.
In this project, we focus on cholestasis, a disease that disrupts the proper transport of bile acids from hepatocytes to the intestine. Cholestasis can be caused by blockages or genetic mutations that alter the structure and function of hepatocytes. It can also be caused by hepatic inflammation due to a systemic inflammatory response, such as sepsis.
Taking advantage of advances in interactomics, proteomics, phosphoproteomics and image processing obtained during the TomoXliver project, we will conduct a multidisciplinary study on the effect of progressive familial intrahepatic cholestasis (PFIC) and systemic inflammatory response-induced cholestasis on hepatocytes.
Our objectives are the identification of proteins, microproteins and metabolites related to liver disease progression. In addition, we focus on the dynamics of protein-protein interactions and the structural characterization of relevant proteins in cholestasis, such as ABCB4 and NHERF1, and their conformational changes during cholestasis of genetic origin PFIC3.
Partners
TomoXliver2 - CM Team
Associated Groups and Companies
Associated Groups
ETH – Zurich
Prof. Kaspar Locher
Website: https://biol.ethz.ch/en/the-department/people/person-detail.NDkyMzc=.TGlzdC80NjAsOTIzMDMxMjIy.html
Instituto de Biomedicina de Valencia – CSIC
Prof. Alberto Marina
Companies
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Broadcasting
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PhDThesis: Descripción sistemática de los mecanismos moleculares implicados en la progresión de la PFIC3 en ratones MDR2 -/-. Valoración del efecto terapéutico/paliativo de la metiltioadenosina (MTA). Laboratorio de Proteómica Funcional, CNB-CSIC. Irene Blázquez (En curso, defensa en 2026/27)
MarterThesis: NMR insights into the interaction between the cytoplasmic domain of CB1R and the N-terminal region of CRBN. IQF-CSIC. Ángela Franco Fernández.
2023:
PhDThesis: Study of the molecular mechanisms underlying liver diseases by mass-spectrometry-based proteomics. Laboratorio de Proteómica Funcional, CNB-CSIC. Laura Guerrero (En curso, defensa en 2023).
2022:
CollegeThesis: Estudio de las alteraciones del fosfoproteoma en hígado de pacientes con colestasis familiar. UAM. Carla Díaz-Maroto.
MasterThesis: Caracterización funcional del proteoma de organoides de orgien hepático y estudio de las alteraciones que se producen en un modelo de colestasis. UCM. Irene Blázquez.
2021:
2020:
2019:
MasterThesis: Cuantificación absoluta mediante proteómica dirigida de enzimas del ciclo 1CM (One Carbon Metabolism) en patologías hepáticas. UCM. Laura Guerrero.
2018:
2023
2023:
Guerrero, L., Carmona-Rodríguez, L., Milhano-Santos, F., Ciordia, S., Stark, L., Hierro, L., Vicent, D., Corrales, FJ.
Molecular basis of progressive Familiar Intrahepatic Cholestasis 3. A proteomics study.
bioRxiv.
https://doi.org/10.1101/2023.06.15.545058
Clavería-Cabello, A., Herranz, JM., Latasa, MU., Arechederra, M., Uriarte, I., Pineda-Lucena, A., Prosper, F., Berraondo, P., Alonso, C., Sangro, B., García Marin, JJ., Martinez-Chantar, ML., Ciordia, S., Corrales, FJ., Francalanci, P., Alaggio, R., Zucman-Rossi, J., Indersie, E., Cairo, S., Domingo-Sàbat, M., Zanatto, L., Sancho-Bru, P., Armengol, C., Berasain, C., Fernandez-Barrena, MG., Avila, MA.
Identification and experimental validation of druggable epigenetic targets in hepatoblastoma.
Journal of Hepatology. 10:S0168-8278(23)00405-1.
https://doi.org/10.1016/j.jhep.2023.05.031
Carmona-Rodríguez, L., Gajadhar, AS., Blázquez-García, I., Guerrero, L., Fernández-Rojo, MA., Uriarte, I., Mamani-Huanca, M., López-Gonzálvez, A., Ciordia, S., Ramos, A., Herrero, JI., Fernández-Barrena, MG., Arechederra, M., Berasain, C., Quiroga, J., Sangro, B., Argemi, J., Pardo, F., Rotellar, F., López, D., Barbas, C., Ávila, MA., Corrales, FJ.
Mapping early serum proteome signatures of liver regeneration in living donor liver transplant cases.
Biofactors
https://doi.org/10.1002/biof.1954
2022:
Labat-de-Hoz, L., Comas, L., Rubio-Ramos, A., Casares-Arias, J., Fernández-Martín, L., Pantoja-Uceda, D., Martín, MT., Kremer, L., Jiménez, MA., Correas, I., Alonso, MA.
Structure and function of the N-terminal extension of the formin INF2
Cellular and Molecular Life Sciences. 79(11).
https://doi.org/10.1007/s00018-022-04581-y
Guerrero, L., Paradela, A., Corrales, FJ.
Targeted Proteomics for Monitoring One-Carbon Metabolism in Liver Diseases.
Metabolites. 12(9):779
https://doi.org/10.3390/metabo12090779
Colyn, L., Alvarez-Sola, G., Latasa, MU., Uriarte, I., Herranz, JM., Arechederra, M., Vlachogiannis, G., Rae, C., Pineda-Lucena, A., Casadei-Gardini, A., Pedica, F., Aldrighetti, L., López-López, A., López-Gonzálvez, A., Barbas, C., Ciordia, S., Van Liempd, SM., Falcón-Pérez, JM., Urman, J., Sangro, B., Vicent, S., Iraburu, MJ., Prosper, F., Nelson, LJ., Banales, JM., Martinez-Chantar, ML., Marin, JJG., Braconi, C., Trautwein, C., Corrales, FJ., Cubero, FJ., Berasain, C., Fernandez-Barrena, MG., Avila, MA.
New molecular mechanisms in cholangiocarcinoma: signals triggering- interleukin-6 production in tumor cells and KRAS co-opted epigenetic mediators driving metabolic reprogramming.
Journal of Experimental & Clinical Cancer Research. 26;41(1):183.
https://doi.org/10.1186/s13046-022-02386-2
Guerrero, L., Sangro, B., Ambao, V., Granero, JI., Ramos-Fernández, A., Paradela, A., Corrales, FJ.
Monitoring one-carbon metabolism by mass spectrometry to assess liver function and disease.
Journal of Physiology and Biochemistry. 78(1) pp. 229-243
https://doi.org/10.1007/s13105-021-00856-3
2023:
Grupo MTB – LIV – Madri+d Job Bank Reference: 49631
Grupo RMN – Madri+d Job Bank Reference: 49160
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