TomoXliver2 - CM
Abordaje multiómico y estructural al estudio de los mecanismos de respuesta del hepatocito al daño inflamatorio.
Referencia: S2022/BMD-7232
Este proyecto plantea un estudio multidisciplinar para descubrir biomoléculas que sirvan para vigilar la salud del hígado, detectar las alteraciones que anuncien el inicio de la enfermedad y definir dianas novedosas contra las que dirigir nuevos fármacos.
Objetivos
El hígado es un órgano especializado que desempeña un papel crucial en la regulación del metabolismo, la nutrición y la respuesta inmunitaria. Las enfermedades hepáticas crónicas, como la cirrosis y el cáncer, son responsables de más de 2 millones de muertes cada año.
En este proyecto, nos enfocamos en la colestasis, una enfermedad que interrumpe el transporte adecuado de ácidos biliares desde los hepatocitos hasta el intestino. La colestasis puede ser causada por obstrucciones o mutaciones genéticas que alteran la estructura y función de los hepatocitos. También puede ser provocada por inflamación hepática debido a una respuesta inflamatoria sistémica, como la septicemia.
Aprovechando los avances en interactómica, proteómica, fosfoproteómica y procesamiento de imágenes obtenidos durante el proyecto TomoXliver, llevaremos a cabo un estudio multidisciplinario sobre el efecto de la colestasis intrahepática familiar progresiva (PFIC) y la colestasis inducida por respuesta inflamatoria sistémica en los hepatocitos.
Nuestros objetivos son la identificación de proteínas, microproteínas y metabolitos relacionados con la progresión de enfermedades hepáticas. Además, nos enfocamos en la dinámica de las interacciones proteína-proteína y la caracterización estructural de proteínas relevantes en la colestasis, como ABCB4 y NHERF1, y sus cambios conformacionales durante la colestasis de origen genético PFIC3.
Our Vision
The liver is a specialized organ that plays a crucial role in regulating metabolism, nutrition and immune response. Chronic liver diseases, such as cirrhosis and cancer, are responsible for more than 2 million deaths each year.
In this project, we focus on cholestasis, a disease that disrupts the proper transport of bile acids from hepatocytes to the intestine. Cholestasis can be caused by blockages or genetic mutations that alter the structure and function of hepatocytes. It can also be caused by hepatic inflammation due to a systemic inflammatory response, such as sepsis.
Taking advantage of advances in interactomics, proteomics, phosphoproteomics and image processing obtained during the TomoXliver project, we will conduct a multidisciplinary study on the effect of progressive familial intrahepatic cholestasis (PFIC) and systemic inflammatory response-induced cholestasis on hepatocytes.
Our objectives are the identification of proteins, microproteins and metabolites related to liver disease progression. In addition, we focus on the dynamics of protein-protein interactions and the structural characterization of relevant proteins in cholestasis, such as ABCB4 and NHERF1, and their conformational changes during cholestasis of genetic origin PFIC3.
Partners
TomoXliver2 - CM Team
Associated Groups
ETH – Zurich
Prof. Kaspar Locher
Website: https://biol.ethz.ch/en/the-department/people/person-detail.NDkyMzc=.TGlzdC80NjAsOTIzMDMxMjIy.html
Instituto de Biomedicina de Valencia – CSIC
Prof. Alberto Marina
Website: https://www.ibv.csic.es/directorio/alberto-marina/
Broadcasting
Miércoles, 25 Octubre 2023:
Cómo y por qué ganar la batalla a la inflamación, según la ciencia.
Miércoles, 17 Mayo 2023:
Inflamación crónica: cómo evitar que el cuerpo viva en estado de alerta.
Jueves, 23 Marzo 2023:
El CNB-CSIC lidera uno de los cinco proyectos de I+D en biomedicina de la comunidad de Madrid.
Lunes, 6 de marzo de 2023:
Presentación de la Jornada “Ayudas para la realización de Programas de Actividades de I+D entre Grupos de Investigación de la Comunidad de Madrid en Biomedicina 2022”.
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ProteoCNB
- Study of the molecular mechanisms underlying liver diseases by mass-spectrometry-based proteomics.
Autor: Laura Guerrero. Director: Fernando Corrales. PhDThesis. - Descripción sistemática de los mecanismos moleculares implicados en la progresión de la PFIC3 en ratones MDR2 -/-. Valoración del efecto terapéutico/paliativo de la metiltioadenosina (MTA).
Autor: Irene Blázquez. Director: Ferrando Corrales. PhDThesis
IQF-CSIC
- NMR insights into the interaction between the cytoplasmic domain of CB1R and the N-terminal region of CRBN.
Autor: Ángela Franco Fernández. Director: M. Ángeles Jiménez. Master Thesis.
MTB-LIV (CEU)
- Caracterización del perfil metabólico de plasma humano mediante cromatografía de interacción hidrofílica acoplada a espectrometría de masas (HILIC-MS)
Autor: Rubén Carrasco Hernández Director: María Ángeles López Gonzálvez. Master Thesis. - Desarrollo e implementación de métodos para el análisis de compuestos polares en el hígado mediante HILIC-MS, RP-LC-MS, GC-MS, CE-ME. Estudio metabolómico multiplataforma.
Autor: Sara Moreno Talavera Director: Francisco Javier Rupérez Pascualena y María Ángeles López Gonzálvez. PhDThesis.
2024:
- M. A. Jiménez. “Understanding protein interactions using solution NMR & a “divide-and-conquer” approach”. Mini-symposium: Molecular assemblies in health and disease, Institut Européen de Chimie et Biologie (IECB), Pessac, France, 4th April 2024. Invited speaker.
2023:
- M. A. Jiménez, “Understanding protein interactions using NMR studies of model peptides”, XVIII Iberian Peptide Meeting, Sesimbra, Portugal, 27-29 November 2023. Selected Oral Communication.
- 09 Octubre 2023: Segunda reunión de seguimiento científico del proyecto.
- 13 Abril 2023: Primera reunión de seguimiento científico del proyecto.
- 06 Marzo 2023: Presentación de la Jornada “Ayudas para la realización de Programas de Actividades de I+D entre Grupos de Investigación de la Comunidad de Madrid en Biomedicina 2022”.
- 08 Febrero 2023: Reunión de constitución del consorcio y distribución del presupuesto.
- M. A. Jiménez. “NMR insights into structures and interactions of peptides and proteins of biomedical relevance”. Departments of Chemistry and Biochemistry, Universidad de Lisboa, Portugal, 26th January, 2023. Invited seminar.
2024:
Guerrero, L., Vindel-Alfageme, J., Hierro, L., Stark, L., Vicent, D., Sorzano, C. Ó., & Corrales, F. J.
Discrimination of etiologically different cholestasis by modeling proteomics datasets.
International Journal of Molecular Sciences, 25(7), 3684.
https://doi.org/10.3390/ijms25073684
Guerrero, L., Carmona‐Rodríguez, L., Santos, F. M., Ciordia, S., Stark, L., Hierro, L., Pérez‐Montero, P., Vicent, D., & Corrales, F. J.
Molecular basis of progressive familial intrahepatic cholestasis 3. A Proteomics Study.
BioFactors.
https://doi.org/10.1002/biof.2041
Blázquez-García, I., Guerrero, L., Cacho-Navas, C., Djouder, N., Millan, J., Paradela, A., Carmona-Rodríguez, L., & Corrales, F. J.
Molecular insights of cholestasis in MDR2 knockout murine liver organoids.
Journal of Proteome Research, 23(4), 1433–1442.
https://doi.org/10.1021/acs.jproteome.3c00900
Cacho-Navas, C., López-Pujante, C., Reglero-Real, N., Colás-Algora, N., Cuervo, A., Conesa, J. J., Barroso, S., de Rivas, G., Ciordia, S., Paradela, A., D’Agostino, G., Manzo, C., Feito, J., Andrés, G., Molina-Jiménez, F., Majano, P., Correas, I., Carazo, J.-M., Nourshargh, S., … Millán, J.
ICAM-1 nanoclusters regulate hepatic epithelial cell polarity by leukocyte adhesion-independent control of apical actomyosin.
eLife, 12.
https://doi.org/10.7554/elife.89261.3
2023:
Chamoso-Sánchez, D., Rabadán Pérez, F., Argente, J., Barbas, C., Martos-Moreno, G.A., & Rupérez, F.J.
Identifying subgroups of childhood obesity by using multiplatform metabotyping.
Frontiers in Molecular Biosciences.
https://doi.org/10.3389/fmolb.2023.1301996
Guerrero, L., Carmona-Rodríguez, L., Milhano-Santos, F., Ciordia, S., Stark, L., Hierro, L., Vicent, D., Corrales, FJ.
Molecular basis of progressive Familiar Intrahepatic Cholestasis 3. A proteomics study.
bioRxiv.
https://doi.org/10.1101/2023.06.15.545058
Carmona-Rodríguez, L., Gajadhar, AS., Blázquez-García, I., Guerrero, L., Fernández-Rojo, MA., Uriarte, I., Mamani-Huanca, M., López-Gonzálvez, A., Ciordia, S., Ramos, A., Herrero, JI., Fernández-Barrena, MG., Arechederra, M., Berasain, C., Quiroga, J., Sangro, B., Argemi, J., Pardo, F., Rotellar, F., López, D., Barbas, C., Ávila, MA., Corrales, FJ.
Mapping early serum proteome signatures of liver regeneration in living donor liver transplant cases.
Biofactors
https://doi.org/10.1002/biof.1954
Colás-Algora, N., Muñoz-Pinillos, P., Cacho-Navas, C., Avendaño-Ortiz, J., de Rivas, G., Barroso, S., López-Collazo, E., & Millán, J.
Simultaneous targeting of IL-1–signaling and IL-6–trans-signaling preserves human pulmonary endothelial barrier function during a cytokine storm—Brief report.
Arteriosclerosis, Thrombosis, and Vascular Biology
https://doi.org/10.1161/atvbaha.123.319695
Cacho-Navas, C., López-Pujante, C., Reglero-Real, N., Colás-Algora, N., Cuervo, A., Conesa, J. J., Barroso, S., de Rivas, G., Ciordia, S., Paradela, A., D’Agostino, G., Manzo, C., Feito, J., Andrés, G., Correas, I., Carazo, J. M., Nourshargh, S., Huch, M., & Millán, J.
ICAM-1 Nanoclusters Regulate Hepatic Epithelial Cell Polarity by Leukocyte Adhesion-Independent Control of Apical Actomyosin.
eLife
https://doi.org/10.7554/elife.89261.1
2023:
- Grupo RI
Madrid Job Bank Reference: 51705
Puesto: Personal Investigador de Apoyo
Función: Realizará varias técnicas de laboratorio (microscopía confocal, citometría de flujo, ELISA y LegendPLEX). También modelos in vivo e in vitro. Deberá, además, analizar e interpretar datos complejos, y contribuir a la escritura reportes. - Grupo MTB – LIV
Madrid Job Bank Reference: 49631 (Oferta Cancelada)
Puesto: Personal Investigador de Apoyo
Función: Desarrollo e implementación de métodos para el análisis de compuestos polares en hígado mediante HILIC-MS, RP-LC-MS, GC-MS, CE-MS. Estudio Metabolómico multiplataforma.
Madrid Job Bank Reference: 50262 (Puesto Cubierto)
Puesto: Personal Investigador de Apoyo
Función: Desarrollo e implementación de métodos para el análisis de compuestos polares en hígado mediante HILIC-MS, RP-LC-MS, GC-MS, CE-MS. Estudio metabolómico multiplataforma. - Grupo RMN
Madrid Job Bank Reference: 49160 (Inscripción cerrada)
Puesto: Personal Investigador de apoyo
Función: Expresión, purificación y estudio estructural por RMN de proteínas relevantes en colestasis hepática - Grupo ProteoCNB
Madrid Job Bank Reference: 50599 (Inscripción cerrada)
Puesto: Personal Investigador de Apoyo
Función: Estudio de los mecanismos moleculares de la enfermedad hepática mediante técnicas ómicas y de imagen.
- Grupo BCU
Madrid Job Bank Reference: 51188 (Inscripción cerrada)
Puesto: Personal Investigador de Apoyo
Función: Codificación de algoritmos de procesamiento de imagen para tomografía y microscopia electrónica, diseñados para trabajar con grandes formatos de imagen utilizando unidades de procesamiento gráficos. - Grupo BCI
Madrid Job Bank Reference: 51238 (Inscripción cerrada)
Puesto: Personal Investigador de Apoyo
Función: Análisis de resistencia transendotelial mediante aplicación de electrodos a células.
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